PyMol軟件介紹
軟件的作者宣稱，在所有正式發(fā)表的科學文獻中的蛋白質結構圖像中，有四分之一是使用PyMOL來制作。PyMOL是少數(shù)可以用在結構生物學領域的開放源代碼視覺化工具。軟件以Py+MOL命名：“Py”表示它是由一種計算機語言Python所衍生出來的，“MOL”表示它是用于顯示分子(英文為molecule)結構的軟件。
PyMol軟件特色
PyMOL的界面主要由兩個部分組成，控制窗口(Control window)和顯示窗口(Viewing window)。其中控制窗口主要包括菜單欄(Pull-down menus)、操作記錄窗口(Feedback window)、常用控制按鈕窗口(Control Buttons)、命令窗口(Command line);顯示窗口主要包括可視化窗口(Display area)、對象列表(Object menu)、鼠標模式(Mouse hints)、動畫控制(Movie controls)以及命令窗口(Command line)。
PyMol軟件操作
在對象列表窗口可以看到，每個對象都有A S H L C五個按鈕，這五個按鈕分別表示Action、Show、Hide、Label、Color，可以對相應的對象完成一些操作。
“A”按鈕可對相應對象進行各種處理，如居中、重命名、標記、刪除等等;也可以使用預設的方案展示3D結構。
“S”按鈕可設置相應對象的顯示樣式
“H”按鈕可隱藏相應對象的某種樣式，也可以靈活的隱藏某些特定結構
“L”按鈕可對相應對象添加標簽此外，可以在菜單欄點擊“Setting -> Label”對標簽的字體、大小、顏色等進行更改添加標簽后，標簽可能會被結構遮擋，此時就需要移動標簽。在鼠標模式窗口，點擊“Mouse Mode”后面的“3-Button Viewing”變?yōu)椤?-Button Editing”，然后按住鍵盤“Ctrl”鍵不放，將鼠標移動到殘基標簽上方，并按下鼠標左鍵不放，然后拖動鼠標，就可以調整標簽的位置。
“C”按鈕可對相應對象的顏色進行更改，可選擇使用系統(tǒng)預設的配色方案，如點擊“C -> by ss -> Helix Sheet Loop”使3D結構按照二級結構著色。
PyMol更新日志
1.將bug掃地出門進行到底
2.有史以來最穩(wěn)定版本
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在經(jīng)歷了那么多年的更新與優(yōu)化，PyMol變得更加人性化，也更加的具有科技感，強烈推薦給大家，歡迎下載。感興趣的還可以下載搜狗輸入法、搜狗輸入法、WPS Office For Linux DEB(64bit)、WPS Office For Linux rpm、WPS Office For Linux rpm(64bit)。
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